Taustayhteisöt muodostavat Vates-säätiön valtuuskunnan. Säätiöllä on 46 taustayhteisöä (tilanne 12/2018), joista osa on Vatesin perustajayhteisöjä, osa liittynyt myöhemmin taustayhteisöiksi.
Avain-säätiö sr
Buusti ry (ent. Etelä-Pohjanmaan sosiaalipsykiatrinen yhdistys ry)
Caritas-Säätiö sr
Epilepsialiitto ry
Etelä-Suomen aluehallintovirasto
Eteva kuntayhtymä
Filha ry
Förbundet De Utvecklingsstördas Väl, FDUV
Hengitysliitto ry
Invalidiliitto ry
Kanta-Hämeen Hengitys ry
Kehitysvammaisten Tukiliitto ry
Kehitysvammaliitto ry
Kevama Oy
Kiipulasäätiö sr
Kokkotyö-säätiö
Kuntoutussäätiö sr
Kuuloliitto ry
Kuurojen Liitto ry
Kuurojen Palvelusäätiö sr
Kårkulla Samkommun
Lahden Työn Paikka Oy
Laptuote-Säätiö sr
Lihastautiliitto ry
Meriva sr
Mielenterveyden keskusliitto ry
Neuroliitto ry
Nuorten Ystävät ry
Näkövammaisten liitto ry
Parik-säätiö sr
Pohjois-Karjalan Sosiaaliturvayhdistys ry
Puustellin tuki ry
Päijät-Hämeen Hengitysyhdistys ry
Rinnekoti-Säätiö sr
Satakunnan sairaanhoitopiirin kuntayhtymä
Silta-Valmennusyhdistys ry
Sininauhaliitto ry
Sosiaalipalvelusäätiö Ote sr (aik. Raina-säätiö sr)
Suomen CP-Liitto ry
Suomen Klubitalot ry
Suomen Mielenterveysseura ry
TITRY ry
TOIMI-työvalmennussäätiö sr
Turun Seudun Hengitysyhdistys ry
Uudenmaan Vammaispalvelusäätiö sr
Yritystaito Oy